88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1237 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  100 
 
 		 172 aa  346  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  76.83 
 
 		 224 aa  253  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  68.67 
 
 		 376 aa  224  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  61.45 
 
 		 373 aa  203  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  40.48 
 
 		 341 aa  91.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  42.28 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2959  hypothetical protein  32.65 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0239  putative transposase  28.81 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2033  putative transposase  28.81 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5033  putative transposase  28.81 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.0166306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6643  putative transposase  28.81 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  23.46 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  32.34 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  32.34 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  32.34 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  32.34 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  32.34 
 
 		 357 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  22.35 
 
 		 377 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  29.11 
 
 		 282 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  21.76 
 
 		 377 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 363 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  25.31 
 
 		 355 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 363 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  27.93 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  33.63 
 
 		 375 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  27.93 
 
 		 220 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  27.93 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  27.93 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  35.04 
 
 		 363 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  34.11 
 
 		 363 aa  48.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  35.04 
 
 		 363 aa  48.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  34.11 
 
 		 363 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  39.08 
 
 		 387 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  39.08 
 
 		 387 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  39.08 
 
 		 387 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  33.33 
 
 		 363 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  33.33 
 
 		 363 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  25.47 
 
 		 346 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  32.2 
 
 		 211 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  33.88 
 
 		 376 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  30.46 
 
 		 363 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  30.46 
 
 		 363 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  30.46 
 
 		 363 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  33.88 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  33.78 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5772  hypothetical protein  43.86 
 
 		 61 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  31.53 
 
 		 333 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  29.61 
 
 		 363 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 349 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4634  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 350 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  26.8 
 
 		 363 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  32.43 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  30.63 
 
 		 243 aa  40.8  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  28.95 
 
 		 362 aa  40.8  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  31.82 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  30.63 
 
 		 242 aa  40.8  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>