187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3961 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  100 
 
 		 341 aa  705    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5771  hypothetical protein  74.4 
 
 		 250 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2666  hypothetical protein  74.24 
 
 		 132 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  39.58 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  34.74 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4365  hypothetical protein  84.88 
 
 		 176 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2891  hypothetical protein  46.41 
 
 		 197 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.20151  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  37.43 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  27.69 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  27.07 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  27.07 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  27.07 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1237  putative transposase  40.48 
 
 		 172 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3050  hypothetical protein  77.55 
 
 		 60 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  26.38 
 
 		 391 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  27.61 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  25 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  26.79 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  24.77 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  24.77 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  26.79 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  27.3 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  24.62 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  28.1 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  27.64 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  27.79 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  27.36 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  24.78 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.07 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.07 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.07 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.07 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.07 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  25.91 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  25.91 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  25.91 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5772  hypothetical protein  83.72 
 
 		 61 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  24.78 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  24.78 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  25.55 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  24.78 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  25.55 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  25.55 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  24.3 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  26.11 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  24.43 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  26.52 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  26.52 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  25.55 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  24.5 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  25.55 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  25.55 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  25.55 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  25.55 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  25.23 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  25.23 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  25.23 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  25.23 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  25.23 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  25.23 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  26.32 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  26.4 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  26.35 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  22.15 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  29.25 
 
 		 626 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  29.03 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  23.08 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  26.03 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>