171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5771 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5771  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  74.4 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2666  hypothetical protein  78.03 
 
 		 132 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2891  hypothetical protein  45.77 
 
 		 197 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.20151  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  39.27 
 
 		 373 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  34.91 
 
 		 376 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3050  hypothetical protein  85.42 
 
 		 60 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  27.39 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  27.39 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  29.15 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 353 aa  72  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 353 aa  72  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  26.32 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  28.36 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  30.14 
 
 		 363 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  26.11 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  26.11 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  26.11 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  25.66 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  26.22 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  25.66 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  29.67 
 
 		 583 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  29.67 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  27.96 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  25.66 
 
 		 363 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  26.58 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  26.58 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  26.58 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  27.23 
 
 		 365 aa  65.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  27.23 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  30 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  30.57 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  27.23 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  29.41 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  27.23 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  27.23 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  27.23 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  27.23 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  27.23 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  27.23 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  25.66 
 
 		 626 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  27.36 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  25.66 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  27.48 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  25.82 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  25.82 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  25.69 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  25.11 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  25.11 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  25.11 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  25.11 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  25.11 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  25.34 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  25.34 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  25.34 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  26.24 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  26.09 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  27.65 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  26.37 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  25.85 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  27.52 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  24.26 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  26.47 
 
 		 365 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  26.15 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>