114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2042 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  92.31 
 
 		 169 aa  320  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  70.91 
 
 		 356 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  70.91 
 
 		 356 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  70.91 
 
 		 356 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  70.3 
 
 		 356 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.33 
 
 		 353 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.33 
 
 		 353 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  51.57 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  48.17 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  48.47 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  46.71 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  47.77 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  43.64 
 
 		 352 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  46.95 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  49.62 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6134  hypothetical protein  39.38 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  34.59 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  34.59 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  34.59 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  34.59 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  34.59 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  33.96 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  40.69 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4313  putative transposase protein  36.24 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  32.45 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  32.45 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  32.45 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  35.14 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  35.14 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3611  hypothetical protein  52.33 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.159699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  32.24 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  32.24 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  32.24 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  32.24 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  32.43 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  32.24 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  31.62 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  33.61 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  31.39 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8498  hypothetical protein  44.71 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  28.29 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  28.29 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.75 
 
 		 333 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  26.51 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  28.03 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  28.03 
 
 		 345 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26 
 
 		 333 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.36 
 
 		 338 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  29.53 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  27.69 
 
 		 345 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1809  hypothetical protein  27.15 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00804246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1018  hypothetical protein  27.15 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.299945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  23.31 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  22.97 
 
 		 327 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 327 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1059  hypothetical protein  26.58 
 
 		 96 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482795  normal  0.334921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0848  transposase ISA1083-3, ISORF2  27.96 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 327 aa  44.3  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  26.67 
 
 		 342 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  26.67 
 
 		 342 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  26.67 
 
 		 342 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0131759  hitchhiker  0.00697344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  28.57 
 
 		 350 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.19 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.63 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>