116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2910 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2910  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  343  6e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  27.17 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.34 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.34 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.34 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.34 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.34 
 
 		 350 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.9 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.52 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  30.82 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.83 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.2 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  30.14 
 
 		 363 aa  54.3  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  30.14 
 
 		 363 aa  54.3  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.84 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  30.14 
 
 		 363 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  30.14 
 
 		 363 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  33.61 
 
 		 355 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  29.29 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  30.14 
 
 		 363 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  25.29 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  24.28 
 
 		 377 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4118  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.78 
 
 		 338 aa  51.2  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  31.4 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  31.4 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  31.4 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  31.4 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2446  putative transposase  31.4 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  29.29 
 
 		 355 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  29.29 
 
 		 355 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  29.29 
 
 		 355 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3425  hypothetical protein  26.75 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2679  hypothetical protein  26.75 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2582  transposase  30.58 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  31.33 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  32.14 
 
 		 350 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  31.9 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 363 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 363 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  29.14 
 
 		 363 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 363 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  29.79 
 
 		 282 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  35.71 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  35.71 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  35.71 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  32.46 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  32.46 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 363 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  25.71 
 
 		 364 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 363 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 363 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2747  hypothetical protein  26.67 
 
 		 373 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  29.73 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0409  hypothetical protein  27.21 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0578  hypothetical protein  28.93 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  38.75 
 
 		 391 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  34.86 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  34.17 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  27.81 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  28.19 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  28.19 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 337 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0726  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2414  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.203324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2562  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 337 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2855  helix-turn-helix Psq domain protein  22.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00593097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  30.83 
 
 		 356 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  27.01 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4384  hypothetical protein  26.28 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  43.06 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  25.4 
 
 		 311 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  25.87 
 
 		 345 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>