266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0211 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  86.9 
 
 		 159 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  86.9 
 
 		 159 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  84.14 
 
 		 159 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  84.14 
 
 		 159 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  84.14 
 
 		 159 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  74.31 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  74.31 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  74.31 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  74.31 
 
 		 159 aa  221  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  73.61 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  73.61 
 
 		 159 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  84.11 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  84.11 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  85.11 
 
 		 94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  70.43 
 
 		 127 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  52.82 
 
 		 161 aa  153  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  52.82 
 
 		 161 aa  153  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  52.82 
 
 		 161 aa  153  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  52.82 
 
 		 161 aa  153  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  52.82 
 
 		 161 aa  153  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  52.11 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  46.53 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  47.33 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  44.03 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  41.46 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  44.55 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0849  ISSod10, transposase OrfA  87.5 
 
 		 61 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  30.88 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  30.88 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  33.33 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  30.66 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  32.59 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  32.59 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  32.59 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  34.75 
 
 		 356 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  34.48 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  34.48 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  33.62 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  27.94 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1715  hypothetical protein  37.18 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  52.05 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1556  hypothetical protein  87.1 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  31.39 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  31.39 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  30.7 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  31.75 
 
 		 355 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  31.75 
 
 		 355 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  31.75 
 
 		 355 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  29.37 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  30.16 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  29.2 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.91 
 
 		 353 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.91 
 
 		 353 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4313  putative transposase protein  30.37 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  29.06 
 
 		 257 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  27.66 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  37.33 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  29.23 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  33.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  33.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  27.48 
 
 		 345 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  33.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  33.91 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  27.48 
 
 		 345 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2446  putative transposase  33.91 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3798  hypothetical protein  26.67 
 
 		 327 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  35.82 
 
 		 387 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  35.82 
 
 		 387 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>