60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1464 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  349  8.999999999999999e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  33.33 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  33.33 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  31.94 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  31.94 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  31.94 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  31.94 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  31.94 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  31.94 
 
 
159 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  32.64 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  32.64 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  29.53 
 
 
161 aa  84  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  29.53 
 
 
161 aa  84  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  29.53 
 
 
161 aa  84  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  29.53 
 
 
161 aa  84  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  29.53 
 
 
161 aa  84  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  29.53 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  29.73 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  29.73 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  29.73 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  30.66 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  27.63 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  32.68 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  34.4 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  29.46 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  26.15 
 
 
150 aa  62  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1715  hypothetical protein  36.99 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  28.14 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1806  transposase and inactivated derivative  44.87 
 
 
123 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.731947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1018  hypothetical protein  28.78 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.299945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1809  hypothetical protein  28.78 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00804246  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  29.5 
 
 
174 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  38.89 
 
 
356 aa  53.9  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  38.89 
 
 
356 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  38.89 
 
 
356 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  38.89 
 
 
356 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  27.68 
 
 
127 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  25.36 
 
 
174 aa  50.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  26.51 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0849  ISSod10, transposase OrfA  35.19 
 
 
61 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  30.93 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  30.93 
 
 
123 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  23.97 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1556  hypothetical protein  38.78 
 
 
58 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>