45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1806 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1806  transposase and inactivated derivative  100 
 
 
123 aa  254  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.731947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  88.79 
 
 
177 aa  193  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  88.79 
 
 
177 aa  193  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  86.92 
 
 
177 aa  163  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  44.87 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  31.68 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  34.18 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  34.18 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  34.18 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  34.18 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  34.18 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  38.03 
 
 
181 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  34.43 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  34.48 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  35.09 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  35.09 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  35.09 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1715  hypothetical protein  35.59 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  33.33 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  33.33 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  32.76 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  32.76 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  32.76 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  32.76 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  32.76 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  32.76 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  25.3 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  33.33 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  31.76 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  37.5 
 
 
356 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>