222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2376 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 150 aa  313  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  66.21 
 
 		 162 aa  208  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  57.48 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  50.75 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  50.75 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  50.75 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  50.75 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  50.75 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  51.08 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  50 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  47.33 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  47.33 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  47.33 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  47.33 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  47.33 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  47.33 
 
 		 146 aa  140  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  45.38 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  45.38 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  45.38 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  45.38 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  45.38 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  44.62 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  43.64 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  45.37 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  45.37 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  42.59 
 
 		 181 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  45.56 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  29.23 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  29.23 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  41.67 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  32.17 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  31.51 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 327 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  28.46 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  26.15 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.34 
 
 		 353 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.34 
 
 		 353 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  31.25 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1715  hypothetical protein  40.51 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.76 
 
 		 350 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  29.46 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.66 
 
 		 350 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  29.46 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  25 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.76 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.76 
 
 		 350 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.66 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.66 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.66 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  29.46 
 
 		 356 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.66 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.97 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  25.33 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  25.38 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  26.19 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  27.73 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  27.73 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  27.73 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  24.03 
 
 		 343 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  29.03 
 
 		 257 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  32.05 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0453  remnant of ISRSO5 transposase protein  26.26 
 
 		 194 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405912 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  26.26 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  23.02 
 
 		 352 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  23.02 
 
 		 352 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  23.02 
 
 		 352 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  23.02 
 
 		 352 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>