87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2837 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  90.3 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  92.19 
 
 		 181 aa  241  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  57.46 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.91 
 
 		 353 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.91 
 
 		 353 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  55.97 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  56.3 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  57.26 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  50.38 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  49.62 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6134  hypothetical protein  44.44 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  46.21 
 
 		 356 aa  87.8  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  46.21 
 
 		 356 aa  87.8  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  40.7 
 
 		 356 aa  87.8  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3611  hypothetical protein  69.74 
 
 		 96 aa  87.8  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.159699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  45.45 
 
 		 356 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  39.39 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  35.51 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8498  hypothetical protein  42.7 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  37.5 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  37.5 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  37.5 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  37.5 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  37.5 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  36.11 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  32.05 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  38.24 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  24.14 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  28.33 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  28.33 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  28.33 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4313  putative transposase protein  32.5 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  27.73 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1059  hypothetical protein  31.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482795  normal  0.334921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  33.98 
 
 		 355 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  32.58 
 
 		 363 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  32.58 
 
 		 363 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.85 
 
 		 350 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  32.58 
 
 		 363 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 		 350 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 		 350 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 		 350 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 		 350 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  32.58 
 
 		 363 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  32.58 
 
 		 363 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  25 
 
 		 327 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  32.58 
 
 		 363 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  25 
 
 		 327 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  25 
 
 		 327 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  26.89 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  26.89 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  26.89 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  26.89 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  26.97 
 
 		 282 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  30.16 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  27.71 
 
 		 211 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  26.89 
 
 		 159 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>