More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0312 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  98.6 
 
 
356 aa  711    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  94.66 
 
 
356 aa  667    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  98.6 
 
 
356 aa  711    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  100 
 
 
356 aa  724    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.41 
 
 
353 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.41 
 
 
353 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  53.28 
 
 
352 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  52.99 
 
 
352 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  52.42 
 
 
352 aa  359  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  70.27 
 
 
187 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  68.65 
 
 
256 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  64.94 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  64.94 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  64.94 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  64.94 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  64.94 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  72.73 
 
 
169 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  70.91 
 
 
169 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  62.79 
 
 
182 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  58.33 
 
 
178 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  50.6 
 
 
177 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  50.31 
 
 
169 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  49.69 
 
 
169 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  50.63 
 
 
169 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 
177 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 
177 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 
177 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 
177 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 
177 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 
177 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 
178 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  43.41 
 
 
185 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  43.41 
 
 
185 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  52.98 
 
 
169 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  42.31 
 
 
187 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  42.31 
 
 
185 aa  156  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  41.76 
 
 
187 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  38.29 
 
 
198 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  38.29 
 
 
198 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  38.29 
 
 
198 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  37.71 
 
 
198 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  37.71 
 
 
198 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  37.14 
 
 
198 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  37.28 
 
 
173 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  47.9 
 
 
181 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  47.83 
 
 
182 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  29.6 
 
 
362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  29.6 
 
 
356 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  57.41 
 
 
134 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  48.12 
 
 
172 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  47.77 
 
 
181 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  41.04 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  41.04 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  41.04 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  41.04 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  40.44 
 
 
143 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  49.62 
 
 
145 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  61.11 
 
 
91 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  48.5 
 
 
181 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  55.24 
 
 
107 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2837  hypothetical protein  40.7 
 
 
187 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  25.16 
 
 
361 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  24.37 
 
 
356 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  36.62 
 
 
172 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  42.72 
 
 
108 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1476  putative transposase protein  45.14 
 
 
172 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  39.81 
 
 
150 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>