269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2041 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  96.26 
 
 		 187 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  68.65 
 
 		 356 aa  278  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  68.48 
 
 		 356 aa  276  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  68.48 
 
 		 356 aa  276  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  68.11 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  61.4 
 
 		 294 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  61.4 
 
 		 294 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  61.4 
 
 		 294 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  61.4 
 
 		 294 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  61.4 
 
 		 294 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.19 
 
 		 353 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.19 
 
 		 353 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  59.55 
 
 		 182 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  58.72 
 
 		 352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  56.98 
 
 		 352 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  56.57 
 
 		 178 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  48.21 
 
 		 177 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  44.24 
 
 		 177 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  44.24 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  44.24 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  44.24 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  44.24 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  44.24 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  44.24 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  46.58 
 
 		 169 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  43.45 
 
 		 187 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  47.13 
 
 		 169 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  43.03 
 
 		 187 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  45.86 
 
 		 169 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  42.07 
 
 		 198 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  42.07 
 
 		 198 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  42.07 
 
 		 198 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  41.52 
 
 		 185 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  41.52 
 
 		 185 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  41.46 
 
 		 198 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  41.46 
 
 		 198 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  40.35 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  41.46 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  39.29 
 
 		 173 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  57.66 
 
 		 134 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  48.12 
 
 		 172 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  50.38 
 
 		 145 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  42.11 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  60 
 
 		 91 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  53.33 
 
 		 107 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4202  hypothetical protein  74.63 
 
 		 67 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4303  hypothetical protein  76.12 
 
 		 67 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  76.12 
 
 		 67 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  37.06 
 
 		 172 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1210  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  72.73 
 
 		 66 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3224  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  32.92 
 
 		 362 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  41.18 
 
 		 108 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  45.98 
 
 		 102 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  38.68 
 
 		 150 aa  88.6  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  54.05 
 
 		 74 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  31.39 
 
 		 138 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  31.65 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  31.65 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  31.65 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  28 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>