293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00184 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  100 
 
 
143 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  100 
 
 
108 aa  228  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00474  transposase  100 
 
 
87 aa  186  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  63.89 
 
 
198 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  63.89 
 
 
198 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  63.89 
 
 
198 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  62.96 
 
 
198 aa  150  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  62.96 
 
 
198 aa  150  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  62.04 
 
 
198 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  59.26 
 
 
187 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  59.26 
 
 
185 aa  139  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  59.26 
 
 
185 aa  139  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  59.26 
 
 
187 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  58.49 
 
 
177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  58.49 
 
 
177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  58.49 
 
 
177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  58.49 
 
 
177 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  58.49 
 
 
177 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  58.49 
 
 
178 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  58.49 
 
 
150 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  57.41 
 
 
185 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  57.55 
 
 
177 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  55.56 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  57.14 
 
 
124 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  71.79 
 
 
82 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  45.37 
 
 
169 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  43.52 
 
 
169 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  43.52 
 
 
177 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  44.44 
 
 
169 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  43.69 
 
 
294 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  43.69 
 
 
294 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  43.69 
 
 
294 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  43.69 
 
 
294 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  43.69 
 
 
294 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  41.75 
 
 
352 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  42.72 
 
 
356 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  42.72 
 
 
356 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  42.72 
 
 
356 aa  96.7  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  41.51 
 
 
187 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.81 
 
 
353 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.81 
 
 
353 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  40.78 
 
 
352 aa  95.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  41.75 
 
 
356 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  41.75 
 
 
352 aa  93.6  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  41.18 
 
 
256 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  38.38 
 
 
172 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  39.81 
 
 
182 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  37.62 
 
 
178 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  63.16 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  35.92 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1714  transposase and inactivated derivative  82.05 
 
 
39 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4312  hypothetical protein  31.48 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  32.69 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  32.69 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  32.69 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  32.69 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  32.69 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  32.69 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  34.57 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3563  hypothetical protein  34.62 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  40.32 
 
 
74 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  37.8 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  36.78 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  36.78 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  36.78 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  45.9 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  30.36 
 
 
172 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  31.52 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  32.29 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06588  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06524  hypothetical protein  38.46 
 
 
343 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04868  hypothetical protein  38.46 
 
 
343 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06351  hypothetical protein  38.46 
 
 
343 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01645  hypothetical protein  38.46 
 
 
321 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>