284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2544 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  100 
 
 
168 aa  346  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  99.4 
 
 
168 aa  343  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  99.4 
 
 
168 aa  343  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  95.83 
 
 
168 aa  336  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  95.83 
 
 
168 aa  336  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  95.83 
 
 
168 aa  336  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  91.43 
 
 
136 aa  205  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  50 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  46.38 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4482  transposase family protein  54.35 
 
 
94 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584954  hitchhiker  0.00016401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  31.9 
 
 
177 aa  94.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  31.9 
 
 
177 aa  94.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  31.29 
 
 
177 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  31.29 
 
 
177 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  31.29 
 
 
177 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  30.95 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  31.9 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  34.78 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  30.67 
 
 
177 aa  90.5  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  34.06 
 
 
198 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  34.06 
 
 
198 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  34.06 
 
 
198 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  33.8 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  33.8 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  31.9 
 
 
187 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  33.33 
 
 
198 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  33.33 
 
 
198 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.29 
 
 
353 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4480  putative transposase  60 
 
 
72 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000754165 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.29 
 
 
353 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  30.3 
 
 
177 aa  84.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  31.52 
 
 
185 aa  84.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  31.52 
 
 
185 aa  84.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  30.91 
 
 
185 aa  84  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  31.01 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  29.17 
 
 
362 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  29.17 
 
 
356 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2875  hypothetical protein  34.53 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  45.88 
 
 
93 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  30.06 
 
 
356 aa  77.4  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  30.06 
 
 
356 aa  77.4  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3951  hypothetical protein  32.74 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  30.06 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  28.75 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  28.29 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  28.29 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  28.29 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  28.29 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  28.29 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  32.74 
 
 
356 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0087  transposase family protein  26.47 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  28.12 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  26.79 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  28.75 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  27.85 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  29.61 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  28.22 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  30.71 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3856  putative transposase  27.7 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.698713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  27.22 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  35.92 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  26.22 
 
 
342 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>