258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0145 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  100 
 
 
138 aa  287  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  52.17 
 
 
172 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  47.1 
 
 
168 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  47.1 
 
 
168 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  46.72 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  46.72 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  46.72 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  46.38 
 
 
168 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4482  transposase family protein  69.01 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584954  hitchhiker  0.00016401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  46.6 
 
 
136 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  50.62 
 
 
93 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.41 
 
 
353 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.41 
 
 
353 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  30.66 
 
 
187 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4480  putative transposase  67.24 
 
 
72 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000754165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  31.39 
 
 
256 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  32.35 
 
 
198 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  32.35 
 
 
198 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  32.35 
 
 
198 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  31.16 
 
 
356 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  30.43 
 
 
356 aa  84.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  30.43 
 
 
356 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  30.43 
 
 
356 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  31.62 
 
 
198 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  31.62 
 
 
198 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  31.62 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  33.04 
 
 
294 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  33.04 
 
 
294 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  33.04 
 
 
294 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  33.04 
 
 
294 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  33.04 
 
 
294 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  28.91 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  28.91 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  28.91 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  34.78 
 
 
187 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  28.91 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  35.56 
 
 
362 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  35.56 
 
 
356 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  35.77 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2875  hypothetical protein  34.96 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  34.06 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  31.34 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  31.34 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  31.34 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  31.34 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  31.34 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  31.34 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  35.14 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  33.93 
 
 
352 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  35.14 
 
 
177 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  33.04 
 
 
352 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2636  transposase family protein  50 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  34.23 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  36 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3951  hypothetical protein  28.99 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  30.6 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  29.93 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  28.99 
 
 
356 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  34.82 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0087  transposase family protein  29.6 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  35.42 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  32.12 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  32.12 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  31.5 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  31.39 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1142  hypothetical protein  64 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>