212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4057 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  96.26 
 
 		 256 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  70.27 
 
 		 356 aa  289  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  70.11 
 
 		 356 aa  287  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  70.11 
 
 		 356 aa  287  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  69.35 
 
 		 356 aa  286  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  63.22 
 
 		 294 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  63.22 
 
 		 294 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  63.22 
 
 		 294 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  63.22 
 
 		 294 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  63.22 
 
 		 294 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  59.89 
 
 		 353 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  59.89 
 
 		 353 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  60.67 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  61.05 
 
 		 352 aa  227  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  59.3 
 
 		 352 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  58.29 
 
 		 178 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  48.82 
 
 		 177 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  45.24 
 
 		 187 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  44.12 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  44.12 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  44.12 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  44.12 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  44.12 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  44.12 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  44.12 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  47.83 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  48.73 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  43.11 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  43.11 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  43.11 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  44.31 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  47.17 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  43.53 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  43.53 
 
 		 185 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  42.51 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  42.51 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  42.35 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  42.51 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  40 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  58.93 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  52.67 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  48.87 
 
 		 172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  42.34 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  42.34 
 
 		 143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  42.34 
 
 		 143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  42.34 
 
 		 143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  42.34 
 
 		 143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  53.33 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  61.11 
 
 		 91 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  37.58 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  33.14 
 
 		 362 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  33.14 
 
 		 356 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  41.51 
 
 		 108 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  45.98 
 
 		 102 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  38.74 
 
 		 150 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  55.41 
 
 		 74 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  31.9 
 
 		 168 aa  88.2  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  31.9 
 
 		 168 aa  88.2  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  31.9 
 
 		 168 aa  87.8  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  31.9 
 
 		 168 aa  87.8  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  31.9 
 
 		 168 aa  87.8  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  30.66 
 
 		 138 aa  87.8  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1019  transposase-like protein  33.92 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.42618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1808  transposase-like protein  33.92 
 
 		 186 aa  87.8  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00181251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  29.79 
 
 		 361 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3951  hypothetical protein  29.59 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>