139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2186 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  100 
 
 		 91 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  84.44 
 
 		 294 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  84.44 
 
 		 294 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  84.44 
 
 		 294 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  84.44 
 
 		 294 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  84.44 
 
 		 294 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  65.17 
 
 		 352 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  63.33 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  62.22 
 
 		 356 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  61.11 
 
 		 356 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  62.92 
 
 		 352 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  61.11 
 
 		 356 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  61.11 
 
 		 356 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  61.11 
 
 		 353 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  61.11 
 
 		 353 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  63.64 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  61.11 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  60 
 
 		 256 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  63.74 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  62.16 
 
 		 74 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  51.11 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  51.11 
 
 		 177 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  53.85 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  50 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  50 
 
 		 169 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  42.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  55.56 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  42.22 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  42.22 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  43.68 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  40 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  41.11 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  40 
 
 		 187 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  56.67 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  38.46 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  38.46 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  38.46 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  38.64 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  37.36 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  37.36 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  37.78 
 
 		 198 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  33.33 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  34.09 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4565  hypothetical protein  34.94 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  44.12 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  45.9 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3951  hypothetical protein  30.95 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  46.77 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  32.14 
 
 		 356 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1289  putative transposase, orfB  45.1 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.472193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  36.36 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  46.67 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  34.52 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1808  transposase-like protein  32.14 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00181251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1019  transposase-like protein  32.14 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.42618 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>