135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7815 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  100 
 
 
74 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  68.92 
 
 
294 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  68.92 
 
 
294 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  68.92 
 
 
294 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  68.92 
 
 
294 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  68.92 
 
 
294 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  65.75 
 
 
352 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  67.57 
 
 
182 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  60.81 
 
 
178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  62.16 
 
 
91 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.11 
 
 
353 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  58.11 
 
 
353 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  60 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  64.06 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  48.65 
 
 
356 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  48.65 
 
 
356 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  48.65 
 
 
356 aa  90.5  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  48.65 
 
 
356 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  55.41 
 
 
187 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  58.11 
 
 
145 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  54.05 
 
 
256 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  70.37 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  45.95 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  40.54 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  40.54 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  46.67 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  40.54 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  44.59 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  43.24 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  45.33 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  45.33 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  41.89 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  41.89 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  41.89 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  41.89 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  41.89 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4312  hypothetical protein  42.25 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  40.54 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  42.65 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  40.54 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  38.89 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  38.89 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  38.89 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  37.5 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  37.84 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  37.84 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  37.84 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  42.19 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  37.5 
 
 
198 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  37.5 
 
 
198 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  36.49 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  40.32 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  36.11 
 
 
198 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  36.76 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1289  putative transposase, orfB  43.33 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.472193 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  44.44 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4565  hypothetical protein  35.29 
 
 
204 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1808  transposase-like protein  37.68 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00181251  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1019  transposase-like protein  37.68 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.42618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  35.82 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0087  transposase family protein  32.35 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>