More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00190 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  100 
 
 
143 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  299  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  299  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  299  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  99.3 
 
 
143 aa  299  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  100 
 
 
108 aa  229  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  67.61 
 
 
198 aa  207  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  67.61 
 
 
198 aa  207  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  67.61 
 
 
198 aa  207  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  66.9 
 
 
198 aa  204  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  66.9 
 
 
198 aa  204  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  66.2 
 
 
198 aa  200  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00474  transposase  100 
 
 
87 aa  186  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  59.86 
 
 
185 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  59.86 
 
 
185 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  58.45 
 
 
185 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  58.45 
 
 
187 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  58.45 
 
 
187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  57.04 
 
 
177 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  57.04 
 
 
177 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  57.04 
 
 
177 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  57.86 
 
 
178 aa  178  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  56.34 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  56.34 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  57.14 
 
 
177 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  50.35 
 
 
173 aa  163  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  44.06 
 
 
169 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  45.45 
 
 
169 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  44.06 
 
 
177 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  56.76 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  43.36 
 
 
169 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  42.65 
 
 
294 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  42.65 
 
 
294 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  42.65 
 
 
294 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  42.65 
 
 
294 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  42.65 
 
 
294 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  42.34 
 
 
187 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  55.45 
 
 
124 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  42.11 
 
 
256 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  41.18 
 
 
352 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  41.01 
 
 
352 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  40.44 
 
 
356 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  40.44 
 
 
352 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  40.44 
 
 
356 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.57 
 
 
353 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  40.44 
 
 
356 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.57 
 
 
353 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  71.79 
 
 
82 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  38.97 
 
 
356 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  39.85 
 
 
172 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  38.06 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  38.24 
 
 
182 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  55.84 
 
 
77 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  35.66 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00186  transposase  100 
 
 
47 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  34.27 
 
 
172 aa  88.2  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  42.86 
 
 
91 aa  87  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  28.91 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00178  transposase  94.59 
 
 
56 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  30.3 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  30.3 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  30.3 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  29.55 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  29.55 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  29.55 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  57.89 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4312  hypothetical protein  30.77 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1714  transposase and inactivated derivative  82.05 
 
 
39 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4494.1  hypothetical protein  64.58 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  37.5 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  30.09 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>