222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1028 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  100 
 
 
124 aa  265  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  82.11 
 
 
187 aa  207  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  79.84 
 
 
187 aa  203  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  71.09 
 
 
177 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  71.09 
 
 
177 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  71.09 
 
 
177 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  70.97 
 
 
185 aa  187  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  70.97 
 
 
185 aa  187  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  70.31 
 
 
177 aa  187  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  70.31 
 
 
177 aa  187  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  69.35 
 
 
185 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  69.53 
 
 
177 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  70.08 
 
 
178 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  74.34 
 
 
150 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  56.76 
 
 
198 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  56.76 
 
 
198 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  55.86 
 
 
198 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  55.86 
 
 
198 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  55.86 
 
 
198 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  55.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  55.45 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  55.45 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  55.45 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  55.45 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  57.14 
 
 
108 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  80.52 
 
 
77 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  52 
 
 
173 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  54.05 
 
 
198 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  62.2 
 
 
82 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00474  transposase  58.33 
 
 
87 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  44.35 
 
 
169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  44.35 
 
 
177 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  43.55 
 
 
169 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  42.4 
 
 
352 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  41.6 
 
 
352 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.62 
 
 
353 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.62 
 
 
353 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  43.97 
 
 
169 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  40.8 
 
 
352 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  37.1 
 
 
294 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  37.1 
 
 
294 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  37.1 
 
 
294 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  37.1 
 
 
294 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  37.1 
 
 
294 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  39.81 
 
 
172 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  40.38 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  35.2 
 
 
187 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  36.8 
 
 
182 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  37.19 
 
 
178 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  33.6 
 
 
356 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  33.6 
 
 
356 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  33.6 
 
 
356 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  32.8 
 
 
356 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  32.8 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  35.85 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1714  transposase and inactivated derivative  69.23 
 
 
39 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4312  hypothetical protein  32 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0496  hypothetical protein  59.62 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  38.46 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  37.65 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  38.46 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  38.46 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  38.46 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  38.46 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  38.46 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.91 
 
 
333 aa  57.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  30.43 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  35.56 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  29.35 
 
 
355 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  29.35 
 
 
355 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  29.35 
 
 
355 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  64.29 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.22 
 
 
338 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  38.24 
 
 
333 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  38.98 
 
 
207 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  34.52 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  36.76 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0801  hypothetical protein  33.71 
 
 
342 aa  53.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>