102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0208.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  100 
 
 		 102 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  90.2 
 
 		 187 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  89.22 
 
 		 187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  85.71 
 
 		 185 aa  183  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  85.71 
 
 		 185 aa  183  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  85.71 
 
 		 185 aa  183  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  84.78 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  84.78 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  84.78 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  83.7 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  83.7 
 
 		 178 aa  166  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  82.61 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  82.61 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  59 
 
 		 198 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  59 
 
 		 198 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  59 
 
 		 198 aa  143  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  58.59 
 
 		 198 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  58 
 
 		 198 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  58.59 
 
 		 198 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  64.37 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  55.17 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  51.72 
 
 		 294 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  51.72 
 
 		 294 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  51.72 
 
 		 294 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  51.72 
 
 		 294 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  51.72 
 
 		 294 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  53.85 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  53.85 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  48.28 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  45.98 
 
 		 187 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  43.82 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  45.98 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  45.98 
 
 		 256 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  41.05 
 
 		 356 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  41.05 
 
 		 356 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  40 
 
 		 356 aa  88.6  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  41.05 
 
 		 356 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0496  hypothetical protein  63.38 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.68 
 
 		 353 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.68 
 
 		 353 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  43.68 
 
 		 352 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  48.72 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  85.71 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  57.89 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  56.14 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  56.14 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  56.14 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  56.14 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  45.98 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4494.1  hypothetical protein  57.14 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  32.56 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  32.56 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4482  transposase family protein  43.86 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584954  hitchhiker  0.00016401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  64.29 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00186  transposase  50 
 
 		 47 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1477  hypothetical protein  34.57 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4565  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  34.48 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  38.6 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3951  hypothetical protein  28.09 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00178  transposase  39.62 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1808  transposase-like protein  28.89 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00181251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  27.78 
 
 		 356 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1019  transposase-like protein  28.89 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.42618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  71.43 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5821  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  35.85 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>