83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4482 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4482  transposase family protein  100 
 
 		 94 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584954  hitchhiker  0.00016401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  69.01 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  55.43 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  52.17 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  52.17 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  52.17 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  54.35 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  54.35 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  54.35 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2636  transposase family protein  55.93 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  34.09 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  34.09 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  34.09 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  32.95 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  32.95 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  32.95 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  33.71 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  34.07 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  33.7 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  32.58 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  35.96 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  35.96 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  35.96 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  33.33 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  30.34 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  30.34 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  30.34 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  43.86 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.87 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.87 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  32.95 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  32.95 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  32.95 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  32.95 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  32.95 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  33.71 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  31.82 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  32.95 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  31.4 
 
 		 169 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  32.53 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  31.11 
 
 		 352 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4565  hypothetical protein  27.47 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1477  hypothetical protein  33.7 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  29.07 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  27.78 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1019  transposase-like protein  28.26 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.42618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1808  transposase-like protein  28.26 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00181251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3951  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  34.62 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>