More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1511 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  100 
 
 
198 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  98.48 
 
 
198 aa  406  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  98.99 
 
 
198 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  98.99 
 
 
198 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  98.48 
 
 
198 aa  406  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  98.99 
 
 
198 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  64.32 
 
 
187 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  63.78 
 
 
187 aa  265  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  61.96 
 
 
185 aa  258  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  61.96 
 
 
185 aa  258  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  60.87 
 
 
185 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  61.58 
 
 
177 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  61.58 
 
 
177 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  61.58 
 
 
177 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  61.58 
 
 
177 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  61.58 
 
 
177 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  62.29 
 
 
178 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  61.02 
 
 
177 aa  247  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  53.49 
 
 
173 aa  204  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  66.2 
 
 
143 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  65.49 
 
 
143 aa  198  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  65.49 
 
 
143 aa  198  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  65.49 
 
 
143 aa  198  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  65.49 
 
 
143 aa  198  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  48.84 
 
 
177 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  48.47 
 
 
169 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  48.47 
 
 
169 aa  178  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  47.85 
 
 
169 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  42.51 
 
 
187 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  40.72 
 
 
294 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  40.72 
 
 
294 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  40.72 
 
 
294 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  40.72 
 
 
294 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  40.72 
 
 
294 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.76 
 
 
353 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.76 
 
 
353 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  54.76 
 
 
150 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  42.35 
 
 
352 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  41.46 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  41.76 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  62.04 
 
 
108 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  37.14 
 
 
356 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  41.18 
 
 
352 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  37.14 
 
 
356 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  37.14 
 
 
356 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  36.57 
 
 
356 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  37.72 
 
 
182 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  58 
 
 
102 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  54.05 
 
 
124 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00474  transposase  64.37 
 
 
87 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  66.25 
 
 
82 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  36.97 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  34.52 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  32.17 
 
 
172 aa  98.6  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  54.55 
 
 
77 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  30.49 
 
 
168 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  30.49 
 
 
168 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  30.49 
 
 
168 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  30.49 
 
 
168 aa  92.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  34.78 
 
 
168 aa  92.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  30.49 
 
 
168 aa  92.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  29.48 
 
 
362 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  29.48 
 
 
356 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  37.04 
 
 
134 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  31.01 
 
 
145 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  31.62 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  35.92 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00186  transposase  75 
 
 
47 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>