236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3115 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  356  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.22 
 
 
353 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  55.22 
 
 
353 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  53.79 
 
 
294 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  53.79 
 
 
294 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  53.79 
 
 
294 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  53.79 
 
 
294 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  53.79 
 
 
294 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  50.38 
 
 
352 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  52.99 
 
 
178 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  48.87 
 
 
352 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  52.24 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  46.15 
 
 
356 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  46.15 
 
 
356 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  47.55 
 
 
356 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  48.87 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  48.12 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  48.12 
 
 
356 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  48.12 
 
 
256 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  48.12 
 
 
177 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  44.76 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  44.76 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  44.76 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  44.14 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  44.06 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  44.06 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  47.37 
 
 
169 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  47.37 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  44.06 
 
 
177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  43.26 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  42.55 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  39.85 
 
 
143 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  39.86 
 
 
185 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  39.86 
 
 
185 aa  120  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  39.85 
 
 
143 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  39.85 
 
 
143 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  39.85 
 
 
143 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  39.85 
 
 
143 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  38.46 
 
 
185 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6305  hypothetical protein  59.41 
 
 
107 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6135  putative transposase  46.76 
 
 
145 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.195866  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  44.35 
 
 
150 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  33.57 
 
 
198 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  33.57 
 
 
198 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  33.57 
 
 
198 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  32.87 
 
 
198 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  32.87 
 
 
198 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  53.85 
 
 
91 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  33.83 
 
 
173 aa  101  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  32.17 
 
 
198 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  60 
 
 
74 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1028  ISSod10, transposase OrfB  39.81 
 
 
124 aa  91.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00184  transposase  38.38 
 
 
108 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  52.56 
 
 
134 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  45.12 
 
 
82 aa  84  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  40.78 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4312  hypothetical protein  37.04 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  36 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  30.71 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  30.71 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00474  transposase  38.46 
 
 
87 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  30.71 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  29.84 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  29.84 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  29.84 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  43.59 
 
 
77 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  34.23 
 
 
362 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  34.23 
 
 
356 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>