75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4494.1 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4494.1  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2276  ISSod10, transposase OrfB  64.58 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2875  ISSod10, transposase OrfB  64.58 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4532  ISSod10, transposase OrfB  64.58 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  64.58 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  60.42 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  60.42 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  60.42 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  60.42 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0208.1  putative transposase  57.14 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  60.42 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3792  ISSod10, transposase OrfB  58.33 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  62.5 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  62.5 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  62.5 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  62.5 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0129  ISSod10, transposase OrfB  58.33 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.207172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0243  ISSod10, transposase OrfB  58.33 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3681  ISSod10, transposase OrfB  54.17 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  56.25 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  54.17 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  54.17 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  54.17 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  53.19 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  53.19 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1511  putative transposase  52.08 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0496  hypothetical protein  42.65 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  46.43 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  46.43 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  46.43 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  46.43 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  46.43 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0851  ISSod10, transposase OrfB  50 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  39.34 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  40.38 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  40.38 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00186  transposase  60 
 
 		 47 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4209  hypothetical protein  95.65 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  44.68 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  40.43 
 
 		 352 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  39.58 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  42.55 
 
 		 356 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  42.55 
 
 		 356 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  42.55 
 
 		 356 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  42.55 
 
 		 356 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  45.83 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.42 
 
 		 353 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.42 
 
 		 353 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  40.38 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00178  transposase  61.54 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>