170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2009 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  100 
 
 
133 aa  274  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  57.48 
 
 
150 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  57.72 
 
 
162 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  48.09 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  41.46 
 
 
146 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  46.97 
 
 
161 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  46.97 
 
 
161 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  46.97 
 
 
161 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  46.97 
 
 
161 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  46.97 
 
 
161 aa  114  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  41.46 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  41.46 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  41.46 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  39.84 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  39.84 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  40.16 
 
 
159 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  40.16 
 
 
159 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  40.16 
 
 
159 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  40.16 
 
 
159 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  46.21 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  39.37 
 
 
159 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  39.37 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  42.48 
 
 
127 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  42.99 
 
 
123 aa  93.2  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  42.99 
 
 
123 aa  93.2  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  47.78 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  30.58 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  30.58 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  31.4 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  34.96 
 
 
327 aa  68.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  34.96 
 
 
327 aa  68.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  34.43 
 
 
327 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  38.37 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  25.83 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  27.12 
 
 
257 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  33.03 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  35.71 
 
 
343 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  35.71 
 
 
343 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  35.71 
 
 
343 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  31.4 
 
 
355 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.07 
 
 
353 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.07 
 
 
353 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01089  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02022  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02463  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02548  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02605  hypothetical protein  29.17 
 
 
343 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05893  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06388  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.41 
 
 
349 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.59 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  28.57 
 
 
356 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  35.48 
 
 
335 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  28.57 
 
 
356 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  22.76 
 
 
363 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.59 
 
 
350 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.59 
 
 
350 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  29.52 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  30.14 
 
 
363 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  35.48 
 
 
335 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.95 
 
 
350 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  22.76 
 
 
363 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  35.29 
 
 
343 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.31 
 
 
350 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02701  hypothetical protein  30.09 
 
 
347 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05208  hypothetical protein  30.09 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05300  hypothetical protein  29.13 
 
 
347 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05606  hypothetical protein  29.46 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05660  hypothetical protein  30.09 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05849  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06044  hypothetical protein  28.33 
 
 
342 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06376  hypothetical protein  30.09 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07122  hypothetical protein  30.09 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  28.57 
 
 
356 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>