91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1553 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  100 
 
 		 159 aa  237  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  99.13 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  99.13 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  99.13 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  99.13 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  97.39 
 
 		 159 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  78.26 
 
 		 159 aa  183  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  78.26 
 
 		 159 aa  183  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  74.78 
 
 		 159 aa  176  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  74.78 
 
 		 159 aa  176  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  74.78 
 
 		 159 aa  176  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  70.43 
 
 		 146 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  69.15 
 
 		 94 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  48.18 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  48.18 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  48.18 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  48.18 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  48.18 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  43.64 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  44.09 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  47.27 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  42.48 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  43.64 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  97.44 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  43.18 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  32.17 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  32.17 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  37.18 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  27.68 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  31.71 
 
 		 327 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  31.71 
 
 		 327 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  31.71 
 
 		 327 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  40.68 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  38.98 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  33.73 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  30.43 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  27.43 
 
 		 352 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  31.82 
 
 		 356 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  27.55 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  32.81 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  33.82 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  33.82 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  33.82 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  32.81 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  32.81 
 
 		 363 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  32.81 
 
 		 363 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  32.81 
 
 		 363 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  33.33 
 
 		 754 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.73 
 
 		 350 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  32.81 
 
 		 363 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  35.19 
 
 		 376 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  32.08 
 
 		 366 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  27.43 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.73 
 
 		 350 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.73 
 
 		 350 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  33.33 
 
 		 335 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  33.33 
 
 		 363 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  33.33 
 
 		 363 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  33.33 
 
 		 363 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>