66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3924 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  100 
 
 
123 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  100 
 
 
123 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  85.05 
 
 
159 aa  190  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  85.05 
 
 
159 aa  190  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  84.11 
 
 
146 aa  188  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  84.95 
 
 
94 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 
159 aa  167  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 
159 aa  167  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 
159 aa  167  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  76.64 
 
 
159 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  76.64 
 
 
159 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  76.64 
 
 
159 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  76.64 
 
 
159 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 
127 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 
159 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  75.7 
 
 
159 aa  163  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  45.37 
 
 
162 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  45.37 
 
 
150 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
161 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
161 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
161 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
161 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  47.22 
 
 
161 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  46.3 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  42.99 
 
 
133 aa  93.2  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  42.73 
 
 
162 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  40.23 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4027  hypothetical protein  54.17 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  24.79 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  24.79 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  32.18 
 
 
327 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  32.18 
 
 
327 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  32.18 
 
 
327 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  37.88 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  30.93 
 
 
167 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  36.76 
 
 
387 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  36.76 
 
 
387 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  36.76 
 
 
387 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  38.1 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02112  isrso5-transposase protein  38.98 
 
 
333 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  27.27 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  33.78 
 
 
363 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  33.78 
 
 
363 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00651  isrso5-transposase protein  37.29 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  33.78 
 
 
363 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  32.14 
 
 
366 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  33.78 
 
 
363 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  33.78 
 
 
363 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04270  isrso5-transposase protein  37.29 
 
 
243 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  33.78 
 
 
363 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  30.86 
 
 
257 aa  40  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>