82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3160 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1715  hypothetical protein  78.89 
 
 
166 aa  147  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  52.14 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  48.72 
 
 
159 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  48.72 
 
 
159 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  49.14 
 
 
161 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  49.14 
 
 
161 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  49.14 
 
 
161 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  49.14 
 
 
161 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  49.14 
 
 
161 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  48.72 
 
 
159 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  48.72 
 
 
159 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  48.72 
 
 
159 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  51.28 
 
 
181 aa  120  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  47.86 
 
 
159 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  47.86 
 
 
159 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  47.86 
 
 
159 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  47.86 
 
 
159 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  48.28 
 
 
161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  47.01 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  47.01 
 
 
159 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  44.55 
 
 
146 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  43.16 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  41.67 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0849  ISSod10, transposase OrfA  64.15 
 
 
61 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  38.37 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  34.82 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1556  hypothetical protein  60.87 
 
 
58 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  31.62 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  33.04 
 
 
356 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  33.04 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  33.04 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  33.04 
 
 
356 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  28.83 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  28.83 
 
 
177 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  37.18 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  31.09 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  37.88 
 
 
123 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  37.88 
 
 
123 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2730  hypothetical protein  34.48 
 
 
174 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.881494  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.93 
 
 
353 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.93 
 
 
353 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4751  hypothetical protein  27 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  39.58 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  26.36 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4313  putative transposase protein  25 
 
 
153 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1806  transposase and inactivated derivative  34.69 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.731947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4780  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4475  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0200  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4293  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4226  transposase  25.71 
 
 
373 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0204  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.724095  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1608  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3170  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2402  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2784  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108617  decreased coverage  0.0022307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2730  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0020  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493218  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1008  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2923  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648951  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3460  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3606  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101133  normal  0.355095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3761  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307691  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4947  transposase  25.71 
 
 
345 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  29.31 
 
 
471 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>