227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3636 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  100 
 
 
160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  43.61 
 
 
179 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0071  IS630 family transposase  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3007  IS630 family transposase  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6341  IS630 family transposase  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4438  IS630 family transposase  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3168  IS630 family transposase  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7159  IS630 family transposase  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0620251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3070  IS630 family transposase  41.67 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.41 
 
 
336 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.41 
 
 
336 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.41 
 
 
336 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.41 
 
 
336 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.41 
 
 
336 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.41 
 
 
336 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.41 
 
 
336 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  36.11 
 
 
311 aa  89  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  35.14 
 
 
257 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2414  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.203324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2562  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2855  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00593097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
337 aa  84.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  39.57 
 
 
337 aa  84.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  36.55 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  34.21 
 
 
342 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  34.21 
 
 
342 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  34.21 
 
 
342 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  41.23 
 
 
350 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0726  helix-turn-helix Psq domain protein  38.21 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  36.57 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  36.57 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  31.58 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  34.97 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  31.58 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.27 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  30.72 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.27 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  32.47 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  37.19 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  30.92 
 
 
324 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  37.19 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
322 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  37.19 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  37.19 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2446  putative transposase  37.19 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
322 aa  67.8  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
351 aa  67.4  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  29.61 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2582  transposase  36.36 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  30.92 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  29.25 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 
352 aa  64.7  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  29.61 
 
 
350 aa  64.3  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  36 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  36 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  36 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  29.41 
 
 
262 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  29.61 
 
 
290 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  31.03 
 
 
348 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  31.03 
 
 
348 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  31.03 
 
 
348 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  30.34 
 
 
348 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  30.34 
 
 
348 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  29.61 
 
 
352 aa  62.4  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  30.34 
 
 
348 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0578  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  29.5 
 
 
347 aa  61.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  34.21 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  37.27 
 
 
308 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  35.2 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  35.2 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  29.77 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  30.25 
 
 
327 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  30.25 
 
 
327 aa  58.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  30.25 
 
 
327 aa  58.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.63 
 
 
345 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  27.63 
 
 
345 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  27.63 
 
 
345 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  27.63 
 
 
345 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3062  hypothetical protein  33.62 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  29.1 
 
 
233 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1175  hypothetical protein  29.58 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  29.58 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.09 
 
 
350 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  29.75 
 
 
344 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  32.91 
 
 
314 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  27.59 
 
 
345 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  28.95 
 
 
345 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  28.95 
 
 
345 aa  54.7  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.12 
 
 
350 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.12 
 
 
350 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  27.59 
 
 
345 aa  54.3  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3674  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.253586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>