118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04110 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04110  transposase  100 
 
 		 176 aa  355  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  96.59 
 
 		 176 aa  343  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  95.98 
 
 		 219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 		 352 aa  336  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 		 351 aa  335  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  95.4 
 
 		 350 aa  333  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  95.4 
 
 		 262 aa  333  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  95.35 
 
 		 322 aa  330  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  94.83 
 
 		 324 aa  330  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  94.25 
 
 		 332 aa  330  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  94.25 
 
 		 332 aa  330  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  93.1 
 
 		 352 aa  327  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  92.53 
 
 		 352 aa  325  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  93.1 
 
 		 352 aa  323  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  94.19 
 
 		 322 aa  323  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  91.95 
 
 		 352 aa  323  9e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  96.36 
 
 		 290 aa  320  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  96.36 
 
 		 225 aa  320  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  95.76 
 
 		 347 aa  317  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  95.12 
 
 		 243 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  91.38 
 
 		 348 aa  307  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  96.32 
 
 		 233 aa  267  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  91.53 
 
 		 293 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  93.33 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  53.99 
 
 		 257 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  47.56 
 
 		 342 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  47.56 
 
 		 342 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  47.56 
 
 		 342 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  43.4 
 
 		 350 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03386  putative transposase  93.22 
 
 		 68 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  36.31 
 
 		 345 aa  101  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  34.19 
 
 		 311 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  37.5 
 
 		 347 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  37.5 
 
 		 352 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  37.5 
 
 		 352 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  37.5 
 
 		 352 aa  97.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  37.5 
 
 		 352 aa  97.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  36.3 
 
 		 348 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  36.3 
 
 		 348 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  34.62 
 
 		 348 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  34.62 
 
 		 348 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  36.3 
 
 		 348 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  35.62 
 
 		 348 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  36.9 
 
 		 342 aa  84.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03678  putative transposase  80.36 
 
 		 56 aa  84.3  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  33.73 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  33.73 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  32.74 
 
 		 344 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  34.56 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  34.56 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  34.56 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  34.56 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  33.33 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.12 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  27.98 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  34.43 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  29.61 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  27.98 
 
 		 345 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  30.91 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  30.91 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  30.77 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  33.93 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 337 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2414  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.203324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2562  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 337 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2855  helix-turn-helix Psq domain protein  26.76 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00593097  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.69 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  30.53 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  36.11 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  32.69 
 
 		 298 aa  45.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3168  IS630 family transposase  30.56 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4438  IS630 family transposase  30.56 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6341  IS630 family transposase  30.56 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7159  IS630 family transposase  30.56 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0620251 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>