93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03387 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03387  transposase  100 
 
 
165 aa  332  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  95.15 
 
 
225 aa  318  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  91.67 
 
 
352 aa  295  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  92.31 
 
 
233 aa  293  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  91.67 
 
 
324 aa  292  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  92.31 
 
 
352 aa  291  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  92.31 
 
 
243 aa  291  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  91.03 
 
 
350 aa  291  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  91.67 
 
 
332 aa  290  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  91.67 
 
 
332 aa  290  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  91.03 
 
 
347 aa  290  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  90.38 
 
 
262 aa  289  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  89.74 
 
 
352 aa  289  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  90.38 
 
 
290 aa  288  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  91.03 
 
 
351 aa  287  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  89.1 
 
 
352 aa  287  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  89.74 
 
 
322 aa  283  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  88.46 
 
 
352 aa  281  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  87.18 
 
 
322 aa  276  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  88.46 
 
 
293 aa  275  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  88.46 
 
 
348 aa  275  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  92.68 
 
 
219 aa  236  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  93.33 
 
 
176 aa  201  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  92.38 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  58.44 
 
 
257 aa  186  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  49.66 
 
 
342 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  49.66 
 
 
342 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  49.66 
 
 
342 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  41.5 
 
 
345 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  40.94 
 
 
345 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  45.27 
 
 
350 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  43.62 
 
 
352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  43.62 
 
 
352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  43.62 
 
 
352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  43.62 
 
 
352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  43.62 
 
 
347 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  39.74 
 
 
342 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  40.97 
 
 
311 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  35.1 
 
 
348 aa  97.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  35.1 
 
 
348 aa  98.2  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  35.1 
 
 
348 aa  97.8  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  35.1 
 
 
348 aa  98.2  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  35.1 
 
 
348 aa  98.2  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  35.1 
 
 
348 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  37.5 
 
 
308 aa  97.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  39.04 
 
 
344 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  37.16 
 
 
350 aa  94.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  38.67 
 
 
314 aa  94.4  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  38.67 
 
 
345 aa  94.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  38.67 
 
 
345 aa  94.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  38.67 
 
 
345 aa  94.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  83.33 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  83.33 
 
 
144 aa  92  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  36.49 
 
 
350 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  33.33 
 
 
345 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  36.7 
 
 
306 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.9 
 
 
345 aa  67.8  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  31.93 
 
 
279 aa  57.4  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  36.67 
 
 
230 aa  57.4  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  32.69 
 
 
230 aa  55.1  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  33.33 
 
 
298 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  37.66 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  32.95 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  29.13 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  35.14 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4438  IS630 family transposase  30.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7159  IS630 family transposase  30.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0620251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6341  IS630 family transposase  30.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3168  IS630 family transposase  30.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3070  IS630 family transposase  30.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3007  IS630 family transposase  30.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0071  IS630 family transposase  30.56 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  34.25 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  33.82 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  33.82 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3105  ISAfe6, transposase, degenerate  35.14 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0268483  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  24.81 
 
 
337 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  24.81 
 
 
337 aa  43.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>