More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04108 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04108  transposase  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  95.08 
 
 
352 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  95.08 
 
 
347 aa  353  8.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  95.6 
 
 
352 aa  352  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  95.08 
 
 
348 aa  352  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  93.99 
 
 
352 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  94.54 
 
 
352 aa  350  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  94.54 
 
 
352 aa  349  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  94.83 
 
 
293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  93.57 
 
 
350 aa  325  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  93.98 
 
 
351 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  95.09 
 
 
332 aa  316  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  95.09 
 
 
332 aa  316  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  92.2 
 
 
322 aa  266  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00314  transposase  96.99 
 
 
133 aa  262  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  97.71 
 
 
144 aa  260  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  95.28 
 
 
324 aa  250  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  93.02 
 
 
322 aa  248  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  85.95 
 
 
290 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02694  transposase  96.7 
 
 
91 aa  181  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  97.78 
 
 
233 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03562  transposase  96.7 
 
 
91 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  95.56 
 
 
262 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00622  transposase  94.44 
 
 
72 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.682708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  41.71 
 
 
342 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  41.71 
 
 
342 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  41.71 
 
 
342 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  93.06 
 
 
243 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  35.26 
 
 
308 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3151  hypothetical protein  69.41 
 
 
123 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.990399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  34.25 
 
 
345 aa  118  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  34.21 
 
 
342 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  33.7 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3189  hypothetical protein  66.28 
 
 
328 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0965465  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  75.76 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  38.73 
 
 
350 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03726  transposase  80 
 
 
77 aa  104  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03388  ISXoo2 transposase  78.46 
 
 
77 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  41.48 
 
 
311 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  29.47 
 
 
344 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.58 
 
 
345 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  30.11 
 
 
345 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  32.45 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  83.33 
 
 
165 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  83.33 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  32.45 
 
 
279 aa  92.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  27.37 
 
 
350 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  30.21 
 
 
347 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  30.21 
 
 
352 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  30.21 
 
 
352 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  30.21 
 
 
352 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  30.21 
 
 
352 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  27.62 
 
 
348 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  27.62 
 
 
348 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  28.25 
 
 
348 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  27.62 
 
 
348 aa  88.6  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  27.62 
 
 
348 aa  88.6  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  26.84 
 
 
350 aa  88.2  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  28.25 
 
 
348 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  29.1 
 
 
345 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  29.1 
 
 
345 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  29.1 
 
 
345 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  29.1 
 
 
314 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.74 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3163  hypothetical protein  56.45 
 
 
82 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.767658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2194  transposase  31.5 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.08 
 
 
349 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3122  hypothetical protein  58.49 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.116578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.56 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.56 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.04 
 
 
350 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>