69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3189 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3189  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0965465  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3168  hypothetical protein  92.16 
 
 
404 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0790246  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3151  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.990399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  66.28 
 
 
202 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02694  transposase  67.47 
 
 
91 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00314  transposase  66.28 
 
 
133 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  65.12 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  66.28 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  60.22 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  65.12 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  65.12 
 
 
352 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  65.12 
 
 
352 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  65.12 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03562  transposase  65.12 
 
 
91 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  65.38 
 
 
293 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  65 
 
 
350 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  70.15 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  70.15 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00622  transposase  65.15 
 
 
72 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.682708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  66.2 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  38.82 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  38.82 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  38.82 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  42.86 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  61.22 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  75 
 
 
144 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  32.47 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03726  transposase  74.29 
 
 
77 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  32.47 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  32.47 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  71.43 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  32.47 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  35.06 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  71.43 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03388  ISXoo2 transposase  71.43 
 
 
77 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  35.9 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  36.14 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.17 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.17 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.17 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.17 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.17 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.17 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  29.87 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.17 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1385  putative transposase  28.21 
 
 
87 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.467321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  28.09 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  28.09 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  28.57 
 
 
345 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2194  transposase  39.22 
 
 
136 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  28.09 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  28.09 
 
 
348 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.1 
 
 
345 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  28.09 
 
 
348 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  28.09 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1869  hypothetical protein  29.63 
 
 
165 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.557561  normal  0.202101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>