267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2088 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  100 
 
 		 342 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  70.63 
 
 		 308 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  43.82 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  43.53 
 
 		 345 aa  279  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  41.28 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  40.99 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.86 
 
 		 345 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  41.11 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  41.45 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  41.45 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  40.87 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  40.87 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  40.87 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  40.87 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  40.87 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  40.87 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  40.87 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  41.16 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  40.72 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  40.72 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  40.72 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  37.61 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  41.56 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  39.12 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  39.12 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  39.12 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  39.21 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  37.5 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  35.96 
 
 		 352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  35.57 
 
 		 347 aa  195  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  36.15 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  35.48 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  36.44 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  36.15 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  38.87 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  35.38 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  36.26 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  37.81 
 
 		 332 aa  185  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  37.81 
 
 		 332 aa  185  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  38.7 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  38.7 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  37.5 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  37.7 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  36.55 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  37.73 
 
 		 230 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  37.73 
 
 		 279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  37.84 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  38.43 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  39.24 
 
 		 233 aa  149  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  38.87 
 
 		 257 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.98 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.98 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.98 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.98 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.98 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.98 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.98 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  37.61 
 
 		 243 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  32.95 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  38.25 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  34.21 
 
 		 202 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  29.29 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  41.86 
 
 		 144 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  39.74 
 
 		 165 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7749  putative transposase  46.36 
 
 		 115 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  37.84 
 
 		 219 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2194  transposase  41.32 
 
 		 136 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  29.58 
 
 		 230 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  36.9 
 
 		 176 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  36.9 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  28.18 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.04 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  25.09 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  25.09 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.02 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00314  transposase  32.06 
 
 		 133 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.23 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.02 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>