143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02693 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02693  transposase  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 
352 aa  510  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 
350 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 
352 aa  510  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 
332 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  95.79 
 
 
352 aa  508  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 
332 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  96.55 
 
 
352 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  95.79 
 
 
351 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  96.53 
 
 
322 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  96.14 
 
 
322 aa  500  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  95.4 
 
 
352 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  95.02 
 
 
324 aa  497  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  96.43 
 
 
290 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  95.63 
 
 
347 aa  488  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  94.25 
 
 
348 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  96.88 
 
 
233 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  95.22 
 
 
243 aa  441  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  93.98 
 
 
225 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  95.61 
 
 
293 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  94.27 
 
 
219 aa  367  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  95.4 
 
 
176 aa  333  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  94.83 
 
 
176 aa  331  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  90.38 
 
 
165 aa  289  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  59.91 
 
 
257 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  43.65 
 
 
342 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  43.65 
 
 
342 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  43.65 
 
 
342 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  94.57 
 
 
144 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  95.56 
 
 
202 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  41.86 
 
 
350 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  37.25 
 
 
345 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  37.45 
 
 
311 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  38.43 
 
 
342 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  35.8 
 
 
347 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  35.8 
 
 
352 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  35.8 
 
 
352 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  35.8 
 
 
352 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  35.8 
 
 
352 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  34.12 
 
 
344 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  32.43 
 
 
348 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  32.43 
 
 
348 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  32.05 
 
 
348 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  32.43 
 
 
348 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  32.43 
 
 
348 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  32.43 
 
 
348 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  36.84 
 
 
308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  32.92 
 
 
350 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  32.51 
 
 
350 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  30.86 
 
 
345 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  30.86 
 
 
345 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  30.86 
 
 
345 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.3 
 
 
345 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  32.59 
 
 
314 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03386  putative transposase  94.92 
 
 
68 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  28.52 
 
 
345 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  32.3 
 
 
279 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  34.85 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00314  transposase  92.86 
 
 
133 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03678  putative transposase  82.14 
 
 
56 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  27.05 
 
 
306 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3163  hypothetical protein  62.26 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.767658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  32.67 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3122  hypothetical protein  60.38 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.116578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  29.21 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  26.72 
 
 
355 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  26.72 
 
 
355 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  26.72 
 
 
355 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  29.41 
 
 
160 aa  63.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  25.95 
 
 
204 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  25.77 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  28.99 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  28.99 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  22.82 
 
 
337 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  22.82 
 
 
337 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  29.14 
 
 
181 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3105  ISAfe6, transposase, degenerate  36.71 
 
 
101 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0268483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.58 
 
 
350 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.58 
 
 
350 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.58 
 
 
350 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.58 
 
 
350 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.58 
 
 
350 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.58 
 
 
350 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>