More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1739 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  100 
 
 
345 aa  709    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  75.07 
 
 
345 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  75.07 
 
 
345 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  75.07 
 
 
345 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  69.08 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  69.08 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  69.08 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  69.08 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  69.08 
 
 
347 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  75.16 
 
 
314 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  53.33 
 
 
345 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  53.04 
 
 
345 aa  358  6e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  53.04 
 
 
345 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  49.71 
 
 
348 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  49.42 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  49.13 
 
 
348 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  48.84 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  48.84 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  48.84 
 
 
348 aa  317  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  44.35 
 
 
344 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  44.51 
 
 
345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  42.77 
 
 
350 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  42.49 
 
 
350 aa  265  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  39.21 
 
 
342 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  40.07 
 
 
308 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  42.52 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  44.84 
 
 
230 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  33.52 
 
 
342 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  33.52 
 
 
342 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  33.52 
 
 
342 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  38.01 
 
 
298 aa  183  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  29.15 
 
 
352 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  29.15 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  31.41 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  28.86 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  29.15 
 
 
352 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  29.15 
 
 
352 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  28.95 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  28.79 
 
 
351 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  31.16 
 
 
348 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  31.25 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  28.48 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  28.48 
 
 
332 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  28.99 
 
 
322 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  28.57 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  28.95 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.05 
 
 
336 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.05 
 
 
336 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.05 
 
 
336 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.05 
 
 
336 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.05 
 
 
336 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.05 
 
 
336 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.05 
 
 
336 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  30.26 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  29.07 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  27.89 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  28.57 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1385  putative transposase  63.1 
 
 
87 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.467321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  28.52 
 
 
262 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  33.48 
 
 
257 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  31.05 
 
 
233 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  30.11 
 
 
202 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  31.02 
 
 
225 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  32.34 
 
 
243 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  23.05 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  23.05 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  23.05 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  33.33 
 
 
165 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  29.85 
 
 
144 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  29.38 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.26 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.35 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.73 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  30.23 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  30.23 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2194  transposase  33.9 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.65 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.65 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.65 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  25.7 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  25.7 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.65 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.65 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  29.07 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>