186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00314 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00314  transposase  100 
 
 
133 aa  270  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  96.99 
 
 
348 aa  268  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  96.99 
 
 
347 aa  265  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  95.49 
 
 
352 aa  263  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  96.99 
 
 
202 aa  262  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  95.49 
 
 
352 aa  262  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  94.74 
 
 
352 aa  260  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  95.45 
 
 
352 aa  258  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  94.74 
 
 
352 aa  258  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  95.16 
 
 
293 aa  244  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  93.5 
 
 
350 aa  236  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  95.69 
 
 
351 aa  228  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  95.58 
 
 
332 aa  224  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  95.58 
 
 
332 aa  224  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02694  transposase  97.78 
 
 
91 aa  179  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03562  transposase  97.78 
 
 
91 aa  175  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  88.17 
 
 
322 aa  173  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  96.25 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  94.94 
 
 
324 aa  161  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  94.94 
 
 
322 aa  159  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00622  transposase  94.44 
 
 
72 aa  141  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.682708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  80.82 
 
 
290 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3151  hypothetical protein  69.41 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.990399  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3189  hypothetical protein  65.52 
 
 
328 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0965465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  41.22 
 
 
342 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  41.22 
 
 
342 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  41.22 
 
 
342 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03726  transposase  80 
 
 
77 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03388  ISXoo2 transposase  78.46 
 
 
77 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  95.24 
 
 
233 aa  89.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  92.86 
 
 
262 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  32.06 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  32.06 
 
 
342 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.77 
 
 
345 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  35.56 
 
 
350 aa  77.4  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  26.72 
 
 
345 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  25.19 
 
 
344 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  25.95 
 
 
345 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  26.72 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  26.72 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  26.72 
 
 
348 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  35.05 
 
 
311 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  26.72 
 
 
348 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  26.72 
 
 
348 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  29.93 
 
 
279 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.57 
 
 
336 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  29.93 
 
 
230 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  26.72 
 
 
348 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  25.58 
 
 
350 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  25.58 
 
 
350 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
349 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.03 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.27 
 
 
350 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.46 
 
 
350 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.46 
 
 
350 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  23.66 
 
 
345 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  23.66 
 
 
345 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  23.66 
 
 
345 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  23.66 
 
 
314 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.64 
 
 
350 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.64 
 
 
350 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  23.48 
 
 
352 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  23.48 
 
 
352 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  23.48 
 
 
352 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  23.48 
 
 
352 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  23.48 
 
 
347 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2194  transposase  28.26 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.83 
 
 
350 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1385  putative transposase  28.57 
 
 
87 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.467321  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3163  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.767658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  36.05 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  36.05 
 
 
213 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28090  transposase or inactivated derivative  36.14 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>