More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3678 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 
344 aa  715    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  55.94 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  55.94 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  55.65 
 
 
348 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  55.65 
 
 
348 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  55.65 
 
 
348 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  55.65 
 
 
348 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  45.35 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  45.06 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  47.54 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  47.25 
 
 
350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  45.38 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  45.38 
 
 
347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  45.38 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  45.38 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  45.38 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  42.61 
 
 
345 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  45.24 
 
 
345 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  45.24 
 
 
345 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  45.24 
 
 
345 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  44.35 
 
 
345 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  46.01 
 
 
314 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  37.61 
 
 
342 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  40.68 
 
 
308 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  44.54 
 
 
279 aa  222  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  45.5 
 
 
230 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  37.39 
 
 
342 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  37.39 
 
 
342 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  37.39 
 
 
342 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  32.16 
 
 
352 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  31.29 
 
 
352 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  38.78 
 
 
306 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  30.99 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  30.99 
 
 
352 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  30.7 
 
 
352 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  34.02 
 
 
322 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  30.41 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  33.45 
 
 
332 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  33.45 
 
 
332 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  33.79 
 
 
350 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  30.9 
 
 
348 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  33.45 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  32.99 
 
 
324 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  32.76 
 
 
322 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  33.79 
 
 
298 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  28.45 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  32.84 
 
 
293 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  34.12 
 
 
262 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  33.46 
 
 
290 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  28.52 
 
 
311 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.44 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.44 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.44 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.44 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.44 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.44 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.44 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  34.47 
 
 
233 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  32.47 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  35.81 
 
 
225 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  29.36 
 
 
257 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  29.47 
 
 
202 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.55 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.47 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.23 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  28.33 
 
 
230 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  39.04 
 
 
165 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.92 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.61 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.61 
 
 
350 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.61 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.61 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  35.29 
 
 
144 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  34.38 
 
 
219 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  28.31 
 
 
204 aa  93.2  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.99 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2194  transposase  35.78 
 
 
136 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  24.48 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  24.48 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  24.48 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  32.74 
 
 
176 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>