79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4038 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  92.65 
 
 
204 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  31.3 
 
 
350 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  30.89 
 
 
350 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  29.17 
 
 
348 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  29.17 
 
 
348 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  29.17 
 
 
348 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  29.17 
 
 
348 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  29.17 
 
 
348 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  29.17 
 
 
348 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  28.33 
 
 
344 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  27.52 
 
 
308 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.64 
 
 
345 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  29.58 
 
 
342 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  30.3 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.5  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  85.1  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  26.98 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  27.92 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  27.92 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  27.92 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  27.92 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  27.92 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  27.72 
 
 
345 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  27.72 
 
 
314 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  27.72 
 
 
345 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  36.84 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  27.72 
 
 
345 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  29.85 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  29.85 
 
 
332 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  29.85 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  29.85 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  29.85 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  27.85 
 
 
342 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  29.85 
 
 
351 aa  72  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  27.85 
 
 
342 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  29.35 
 
 
352 aa  72  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  27.85 
 
 
342 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  29.35 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  29.35 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  29.35 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  29.35 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  29.21 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  28.86 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  28.86 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  29.21 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  23.04 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  26.48 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  28.86 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  29.2 
 
 
350 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  28.95 
 
 
348 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  33.6 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  33.6 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  28.86 
 
 
293 aa  58.9  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  28.96 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  28.17 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  33.93 
 
 
176 aa  55.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7749  putative transposase  32.26 
 
 
115 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  33.93 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  32.69 
 
 
165 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  28.79 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  28.79 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.04 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.04 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.04 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.04 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.04 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.04 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.04 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  29.17 
 
 
160 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  22.67 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  22.67 
 
 
337 aa  45.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>