79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3656 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  92.65 
 
 		 230 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  29.15 
 
 		 348 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  31.05 
 
 		 350 aa  94.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  29.15 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  28.89 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  28.89 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  28.89 
 
 		 348 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  28.31 
 
 		 344 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  28.89 
 
 		 348 aa  92.8  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  30.59 
 
 		 350 aa  91.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  31.46 
 
 		 306 aa  85.1  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  25.76 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  28.18 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  28.18 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  28.18 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  28.18 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  28.18 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  28.18 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.62 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  27.6 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  27.6 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  27.6 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  27.6 
 
 		 314 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  26.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  38.83 
 
 		 257 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  27.14 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  27.14 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  27.14 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  27.14 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  27.14 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  27.14 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  26.67 
 
 		 352 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  26.67 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  26.67 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  27.72 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  26.19 
 
 		 352 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  26.67 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  27.72 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  27.72 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  25.56 
 
 		 345 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  29.81 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  26.67 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  26.19 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  25.95 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  26.49 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  26.54 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  25.54 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  22.38 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  26.19 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  30.1 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  30.1 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  28.03 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  28.03 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  25.54 
 
 		 311 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  29.13 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  29.13 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  30.53 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  30.53 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  32.86 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  24.59 
 
 		 337 aa  45.1  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  24.59 
 
 		 337 aa  45.1  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.85 
 
 		 336 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7749  putative transposase  29.41 
 
 		 115 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>