More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1353 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  100 
 
 		 279 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  100 
 
 		 230 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  54.94 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  45.54 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  45.54 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  45.54 
 
 		 348 aa  221  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  45.54 
 
 		 348 aa  221  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  44.54 
 
 		 344 aa  221  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  45.09 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  45.54 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  44.17 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  43.69 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  42.44 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  43.69 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  43.03 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  43.03 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  43.03 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  43.03 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  43.97 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  43.97 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  43.97 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  43.97 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  43.97 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  39.78 
 
 		 345 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  37.9 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  37.9 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  37.9 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  35.34 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  37.73 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3105  ISAfe6, transposase, degenerate  88.89 
 
 		 101 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0268483  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  32.42 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  33.04 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  31.64 
 
 		 352 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  30.86 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  31.64 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  31.13 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  31.62 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  34.01 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  33.67 
 
 		 350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  30.86 
 
 		 348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  33.67 
 
 		 351 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  32.16 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  32.16 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  32.16 
 
 		 322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  31.48 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  33.16 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  30.12 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.46 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.46 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.46 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.46 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.46 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.46 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.46 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3157  ISAfe6, transposase, degenerate  88.24 
 
 		 97 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0664572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  31.89 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1330  ISAfe2, transposase  65.85 
 
 		 420 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.423267  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  32.3 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  32.45 
 
 		 202 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2194  transposase  39.64 
 
 		 136 aa  92  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  35.07 
 
 		 144 aa  89  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  28.93 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  31.68 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  31.62 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.76 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.76 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.76 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.27 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.79 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.6 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.79 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  32.14 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  25.71 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  25.71 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  25.71 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.77 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  35.29 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3635  putative transposase  28.24 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  28.8 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>