146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2194 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2194  transposase  100 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.198331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  42.28 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  42.28 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  42.28 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  42.42 
 
 		 350 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  42.15 
 
 		 308 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  41.32 
 
 		 342 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.84 
 
 		 345 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  39.64 
 
 		 279 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  39.64 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  37.07 
 
 		 348 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  37.07 
 
 		 348 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  36.21 
 
 		 348 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  37.07 
 
 		 348 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  37.07 
 
 		 348 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  35.78 
 
 		 344 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  37.07 
 
 		 348 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  35.78 
 
 		 350 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  34.86 
 
 		 350 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  45.63 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  40 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  40 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  40 
 
 		 345 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  40 
 
 		 314 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  31.53 
 
 		 345 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  31.5 
 
 		 332 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  31.5 
 
 		 332 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  32.26 
 
 		 348 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  31.5 
 
 		 351 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  31.5 
 
 		 350 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  31.5 
 
 		 352 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  33.9 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  32.26 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  32.26 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  31.5 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  35.2 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  35.2 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  35.2 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  35.2 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  35.2 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  31.5 
 
 		 352 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  33.05 
 
 		 352 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  31.45 
 
 		 352 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  32.26 
 
 		 352 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  31.93 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  32.74 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  32.41 
 
 		 324 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  32.43 
 
 		 322 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.59 
 
 		 350 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.59 
 
 		 350 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.59 
 
 		 350 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00314  transposase  28.26 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.59 
 
 		 350 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 349 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.72 
 
 		 350 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  27.19 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.86 
 
 		 350 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2479  resolvase helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.883551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  24.56 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3635  putative transposase  31.36 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1283  hypothetical protein  34.69 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0782139  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2298  hypothetical protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2854  hypothetical protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3055  hypothetical protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0585926 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3189  hypothetical protein  39.22 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0965465  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  28.24 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1410  transposase  35.94 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176947  normal  0.221999 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3151  hypothetical protein  39.22 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.990399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  24.35 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  24.35 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  24.35 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>