131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1868 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  100 
 
 		 179 aa  348  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0071  IS630 family transposase  75.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3007  IS630 family transposase  75.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3070  IS630 family transposase  75.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3168  IS630 family transposase  75.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4438  IS630 family transposase  75.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6341  IS630 family transposase  75.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7159  IS630 family transposase  75.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0620251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  48.89 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  50.31 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  50.31 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  47.2 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  42.76 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.67 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.67 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.67 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.67 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.67 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.67 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.67 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  38.32 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  38.32 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  38.32 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  38.32 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2582  transposase  38.32 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2446  putative transposase  38.32 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  35.51 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  27.44 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  30.52 
 
 		 352 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  30.52 
 
 		 324 aa  51.6  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  33.09 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  40.22 
 
 		 350 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2414  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.203324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2562  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2855  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 152 aa  51.2  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00593097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3487  hypothetical protein  36.99 
 
 		 387 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  28.68 
 
 		 311 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  30.92 
 
 		 352 aa  51.2  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  30.52 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 337 aa  50.8  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  25.68 
 
 		 337 aa  50.8  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  26.49 
 
 		 348 aa  51.2  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  27.82 
 
 		 159 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  27.82 
 
 		 159 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0629  hypothetical protein  36.3 
 
 		 387 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  31.58 
 
 		 322 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 		 322 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  26.67 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  26.67 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  26.67 
 
 		 348 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0848  transposase ISA1083-3, ISORF2  34.69 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  27.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  27.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  27.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  27.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  27.44 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  25.83 
 
 		 348 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  26.67 
 
 		 348 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  27.61 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  27.61 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  27.61 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  30.26 
 
 		 351 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3674  hypothetical protein  28.69 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  30.92 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  29.87 
 
 		 332 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  29.87 
 
 		 332 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0442  hypothetical protein  35.62 
 
 		 387 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0992939  normal  0.042563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  25.19 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  31.97 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  26.9 
 
 		 350 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  26.9 
 
 		 350 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  36.11 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  30.92 
 
 		 352 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0126  hypothetical protein  35.71 
 
 		 387 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0372  hypothetical protein  34.92 
 
 		 387 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445364  hitchhiker  0.00020178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  34.93 
 
 		 387 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  29.22 
 
 		 352 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  29.22 
 
 		 352 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  28.08 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  34.09 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  34.09 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  35.14 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  33.78 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  35.14 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  40.32 
 
 		 342 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  38.71 
 
 		 345 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  38.71 
 
 		 345 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  38.71 
 
 		 345 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3880  hypothetical protein  35.62 
 
 		 387 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.28 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  38.71 
 
 		 314 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  29.61 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  26.32 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  33.33 
 
 		 356 aa  45.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  32.31 
 
 		 356 aa  45.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  29.61 
 
 		 290 aa  44.3  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  24.79 
 
 		 133 aa  44.3  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>