242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2787 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0126  hypothetical protein  94.83 
 
 
387 aa  732    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0372  hypothetical protein  89.66 
 
 
387 aa  681    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445364  hitchhiker  0.00020178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0442  hypothetical protein  96.38 
 
 
387 aa  745    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0992939  normal  0.042563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0629  hypothetical protein  95.09 
 
 
387 aa  731    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1805  hypothetical protein  88.89 
 
 
387 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  780    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3487  hypothetical protein  95.61 
 
 
387 aa  733    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3880  hypothetical protein  95.35 
 
 
387 aa  738    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0231  hypothetical protein  41.99 
 
 
280 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3631  hypothetical protein  33.47 
 
 
326 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0232  hypothetical protein  54.65 
 
 
94 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  24.22 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  24.22 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  26.15 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1997  transposase  21.28 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4534  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.28 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0375  transposase and inactivated derivatives-like protein  21.28 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  25.64 
 
 
354 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0643  transposase  21.28 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4459  transposase  21.28 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  25 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  24.79 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  24.74 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  23.67 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  23.58 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  27.91 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  26.54 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.53 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  24.65 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  24.65 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  24.65 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.73 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01719  hypothetical protein  23.04 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  28.83 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01714  hypothetical protein  25.21 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02155  hypothetical protein  25.21 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  27.04 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  25.95 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01880  hypothetical protein  25.21 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.37 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02134  hypothetical protein  25.21 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06376  hypothetical protein  25.21 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05660  hypothetical protein  25.21 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07122  hypothetical protein  25.21 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  23.05 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.47 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05300  hypothetical protein  25.21 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  26.79 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1588  IS630 family transposase  22.81 
 
 
345 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08277  transposase  24.9 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05076  hypothetical protein  24.9 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01716  hypothetical protein  24.69 
 
 
327 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02026  hypothetical protein  24.9 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02175  hypothetical protein  24.9 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05645  hypothetical protein  24.9 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04930  hypothetical protein  24.9 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05544  hypothetical protein  24.9 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05606  hypothetical protein  22.49 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  25.73 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  25.73 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  25.73 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  25.73 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06351  hypothetical protein  22.62 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06313  hypothetical protein  22.62 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06971  hypothetical protein  24.69 
 
 
267 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02688  hypothetical protein  24.79 
 
 
347 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02701  hypothetical protein  24.79 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06948  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06090  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05604  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05695  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04868  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07062  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02698  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05079  hypothetical protein  22.91 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06000  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05083  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06677  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  23.69 
 
 
353 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06524  hypothetical protein  24.48 
 
 
343 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  23.69 
 
 
353 aa  63.2  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.95 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  25.44 
 
 
340 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01645  hypothetical protein  24.48 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  26.79 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>