More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3780 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  95.36 
 
 		 345 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  100 
 
 		 345 aa  713    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  88.99 
 
 		 345 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  100 
 
 		 345 aa  713    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  66.47 
 
 		 343 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  66.76 
 
 		 343 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  65.31 
 
 		 343 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  59.48 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  59.18 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  59.18 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  59.24 
 
 		 195 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  27.05 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2896  transposase  74.03 
 
 		 77 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2577  IS630 orf  60.47 
 
 		 86 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.093225  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3282  IS630 family transposase  38.86 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0065  IS630, transposase, truncation  66.2 
 
 		 72 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.54 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0042  IS630, transposase, truncation  61.97 
 
 		 72 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.95 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.38 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.3 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  26.62 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7411  hypothetical protein  29.08 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.65 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  25.3 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  25 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0126  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  24.22 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  27.36 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3487  hypothetical protein  24.57 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  26.54 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  24.2 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  24.2 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  24.2 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  26.21 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  26.54 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0442  hypothetical protein  24.22 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0992939  normal  0.042563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3128  transposase  35.34 
 
 		 168 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05079  hypothetical protein  25.16 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0231  hypothetical protein  25.38 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  26.54 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0629  hypothetical protein  23.93 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  27.39 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  26.21 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1805  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1515  hypothetical protein  30.82 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  25.08 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3880  hypothetical protein  24.57 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  24.58 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0200  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0204  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.724095  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1608  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2402  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2730  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3170  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4293  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4475  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4780  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0020  transposase  23.99 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02463  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2784  transposase  24.13 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108617  decreased coverage  0.0022307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01880  hypothetical protein  24.12 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06388  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02134  hypothetical protein  24.12 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06376  hypothetical protein  24.12 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05660  hypothetical protein  24.12 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1008  transposase  23.7 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2923  transposase  23.7 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648951  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3460  transposase  23.7 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3606  transposase  23.7 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101133  normal  0.355095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3761  transposase  23.7 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307691  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4226  transposase  23.7 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4947  transposase  23.7 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  25.23 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07122  hypothetical protein  24.12 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  26.75 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01089  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02022  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05300  hypothetical protein  24.12 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02548  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  23.97 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05893  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  23.97 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>