90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0884 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2446  putative transposase  100 
 
 
145 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2582  transposase  99.26 
 
 
145 aa  274  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0578  hypothetical protein  77.21 
 
 
158 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  37.19 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  39.6 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  38.79 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3674  hypothetical protein  31.62 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  38.79 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  37.4 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.46 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2910  hypothetical protein  31.4 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  32.73 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7159  IS630 family transposase  43.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0620251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0071  IS630 family transposase  43.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3007  IS630 family transposase  43.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  33.91 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3070  IS630 family transposase  43.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3168  IS630 family transposase  43.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4438  IS630 family transposase  43.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6341  IS630 family transposase  43.55 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.53 
 
 
350 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  24.58 
 
 
350 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.32 
 
 
333 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  33.09 
 
 
350 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.73 
 
 
350 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.73 
 
 
350 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.73 
 
 
350 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
349 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.73 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  33.04 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  33.04 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  33.04 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.73 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.88 
 
 
350 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.73 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.73 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  29.06 
 
 
311 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0726  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2855  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00593097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
337 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
337 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2562  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2414  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.203324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  26.05 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.03 
 
 
336 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  34.21 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  34.21 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  30.88 
 
 
342 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  31.3 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  30.88 
 
 
342 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  30.88 
 
 
342 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.45 
 
 
338 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  31.3 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  31.3 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  31.3 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  31.3 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  26.96 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  26.96 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  26.96 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  26.96 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  26.96 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  30.84 
 
 
177 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  30.84 
 
 
177 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.89 
 
 
333 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  31.03 
 
 
181 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0848  transposase ISA1083-3, ISORF2  33.33 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  31.3 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  30.17 
 
 
350 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  30.17 
 
 
350 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>