66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0769 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  100 
 
 		 195 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  82.61 
 
 		 343 aa  325  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  79.89 
 
 		 343 aa  313  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  77.72 
 
 		 343 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  59.24 
 
 		 345 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  59.24 
 
 		 345 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  59.24 
 
 		 345 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  58.7 
 
 		 345 aa  218  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  54.89 
 
 		 343 aa  201  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  54.89 
 
 		 343 aa  201  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  54.35 
 
 		 343 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2928  hypothetical protein  25.42 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1886  hypothetical protein  28.97 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  30 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  27.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  27.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  27.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  27.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  27.83 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4276  hypothetical protein  64.1 
 
 		 85 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4975  hypothetical protein  25.9 
 
 		 163 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  27.5 
 
 		 377 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2679  hypothetical protein  25.19 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3425  hypothetical protein  25.19 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  26.96 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  27.07 
 
 		 355 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  27.07 
 
 		 355 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  27.07 
 
 		 355 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0520  hypothetical protein  29.45 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1258  IS630 family transposase  29.45 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3067  IS630 family transposase  29.45 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1919  hypothetical protein  29.45 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  26.43 
 
 		 327 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  26.43 
 
 		 327 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  26.43 
 
 		 327 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  28.14 
 
 		 387 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0126  hypothetical protein  30 
 
 		 387 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0442  hypothetical protein  28.14 
 
 		 387 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0992939  normal  0.042563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  25 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3487  hypothetical protein  30 
 
 		 387 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4384  hypothetical protein  23.36 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  27.27 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0629  hypothetical protein  27.13 
 
 		 387 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0226  hypothetical protein  21.37 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.906171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0372  hypothetical protein  28.37 
 
 		 387 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445364  hitchhiker  0.00020178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0409  hypothetical protein  23.74 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 387 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 387 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  28.57 
 
 		 387 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3880  hypothetical protein  27.13 
 
 		 387 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  30.43 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0727  hypothetical protein  20.39 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  31.58 
 
 		 294 aa  41.6  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  31.58 
 
 		 294 aa  41.6  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  31.58 
 
 		 294 aa  41.6  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  31.58 
 
 		 294 aa  41.6  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>