22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4975 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4975  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  336  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1886  hypothetical protein  52.45 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0503  hypothetical protein  63.38 
 
 
71 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3425  hypothetical protein  35.51 
 
 
199 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2679  hypothetical protein  35.51 
 
 
199 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0727  hypothetical protein  34.09 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4384  hypothetical protein  34.09 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0226  hypothetical protein  34.23 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.906171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0409  hypothetical protein  33.58 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  24.46 
 
 
343 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  27.82 
 
 
327 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  27.82 
 
 
327 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  27.82 
 
 
327 aa  52.4  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  25.9 
 
 
195 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.62 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2595  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.66 
 
 
333 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  23.02 
 
 
343 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1451  Transposase and inactivated derivatives-like protein  20.89 
 
 
333 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  22.3 
 
 
343 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4118  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.42 
 
 
338 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2910  hypothetical protein  23.53 
 
 
173 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4164  Transposase and inactivated derivatives-like protein  21.02 
 
 
338 aa  40.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>