152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2928 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2928  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1131    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0125  IS630 transposase  24.7 
 
 		 343 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3131  IS630 transposase  23.81 
 
 		 343 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9055  hypothetical protein  22.16 
 
 		 373 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0015  ransposase of  23.69 
 
 		 345 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.961245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3039  transposase, putative  21.77 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4578  transposase, putative  21.77 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2141  transposase, putative  21.77 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  22.77 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  22.46 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  22.46 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  23.38 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  23.38 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  23.38 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  23.38 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  23.38 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  22.91 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0218  IS630 orf  21.45 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  21.64 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  21.49 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  21.64 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  21.81 
 
 		 376 aa  67  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  21.75 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  21.45 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0769  IS630 family transposase  25.42 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3263  hypothetical protein  19.32 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  21.23 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  21.23 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  21.23 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  20.69 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  20.69 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  20.69 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  20.69 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  20.69 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  20.69 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  20.69 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  20 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2787  hypothetical protein  21.65 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0723  Integrase catalytic region  23.19 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0725  Transposase-like protein  22.89 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234146  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2203  Integrase catalytic region  22.89 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0140131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  20.47 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  21.49 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.44 
 
 		 349 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  20.06 
 
 		 377 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  22.08 
 
 		 343 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  21.49 
 
 		 353 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 353 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  21.27 
 
 		 353 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.69 
 
 		 350 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  20.3 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  21.21 
 
 		 353 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  20.82 
 
 		 363 aa  55.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  20.82 
 
 		 363 aa  54.7  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  20.82 
 
 		 363 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  23.44 
 
 		 355 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  23.44 
 
 		 355 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  23.44 
 
 		 355 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  20.53 
 
 		 363 aa  53.9  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  20.53 
 
 		 363 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2891  hypothetical protein  24.1 
 
 		 197 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.20151  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5771  hypothetical protein  20.85 
 
 		 250 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  20.53 
 
 		 363 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.69 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  20.8 
 
 		 354 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3961  putative transposase  18.02 
 
 		 341 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  19.5 
 
 		 364 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.08 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  19.38 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  19.83 
 
 		 365 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  19.71 
 
 		 287 aa  50.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  21.14 
 
 		 353 aa  50.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>